Llevo un tiempo con la realización de un usb multiboot porque es una herramienta muy útil a la par que economizas espacio al no tener que llevar varios dvd o pendrives de un lado para otro.
Utilizando un pendrive de 32 Gb he insertado las siguientes isos:
Hirens boot: es una herramienta muy potente en su mayoria todo es software libre excepto un par de warez.
Ubuntu rescue remix: es una variante de la distro de ubuntu que se utiliza para pruebas forenses del sistema y puede ser usado en sistemas con poca potencia.
Geebox: basicamente convierte tu pc en un soporte multimedia, es muy util para crear discos duros multimedia.
Backtrack 5: es una distribución muy completa de herramientas para la mejora y prueba de la seguridad de las redes.
Wifiway: es otra distribución completa para la mejora y prueba de la seguridad de las redes.
Freenas: una muy buena solución para la creacion de almacenaje en la nube.
El resto de distristribuciones son para instalacion de sistemas operativos, aunque la mayoria poseen version live.
Crunchbag, Fedora live desktop, Versión desatendida de xp sp3, versión desatendida de 7, ubuntu 12.10.
Para la creación del multiusb he probado la utilización de dos herramientas que se llaman XBoot y Sardu pero ambas solo me funcionaban bien con las distros libres con los Windows me daba problemas; Por ello busque otra herramienta y encontré la llamada Yumi que a diferencia de las otras solo puedes cargar una iso por vez haciendo un poco tedioso la creación pero no me dio los problemas de las anteriores excepto en una iso que el error esta en la propia iso. Su uso es muy sencillo y salvo el tener que introducir una a una es una herrramienta potente y util la cual recomiendo para este proceso, tiene automatizado la insercion del grub que utiliza supergrub para ello.
Aqui teneis las url para las tres herramientas las cuales son de software libre.
XBoot: http://www.pendrivelinux.com/xboot-multiboot-iso-usb-creator/
Sardu: http://www.sarducd.it/
Yumi: http://www.pendrivelinux.com/yumi-multiboot-usb-creator/