Ejemplo de animación utilizando las funciones setInterval y clearInterval.
Para realizar el ejercicio se han utilizado dos archivos, el .html y el javascript. La animación es un texto que va cambiando de color (rojo/azul) en intervalos de medio segundo hasta que le damos al botón de parar.
Podemos ver el código de la animación en el siguiente enlace:
http://jsfiddle.net/alberto_tini20/NL4dL/
Pd: en esta pagina no funciona el código, pero con los archivos locales si.